Доброго дня. Честно, сказать не могу. Но вероятнее всего виной всему уплотнитель багажника или технологические заглушки. Попробуйте смоделировать ситацию. Разложите задние сиденья и попросите кого-нибудь хорошо пролить водой автомобиль. Сами в это время наблюдайте изнутри. Скорее всего, удасться выяснить откуда течь.
Если автомобиль на гарантии, то рекомендую обратиться с этим вопросом к официальному дилеру.